org.springframework.jdbc.datasource.TransactionAwareDataSourceProxy とorg.springframework.orm.jpa.vendor.EclipseLinkJpaVendorAdapter を一緒に使用すると、java.sql.Connection をクローズしてくれません。
EclipseLink を使いたい場合は、TransactionAwareDataSourceProxy ではなく、一層下の DataSource（BasicDataSource など）を使用した方が良いです。
TransactionAwareDataSourceProxy#close() 時のクラス呼び出し階層は以下の通りです。
●EclipseLinkJpaVendorAdapter
└EclipseLinkJpaDialect
└SimpleConnectionHandle ←Connection をクローズしてくれない orz
●【参考】HibernateJpaVendorAdapter
└HibernateJpaDialect
└HibernateConnectionHandle ←Connection をクローズしてくれる！
